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随着各种生物基因组序列测定工作的完成，大量的DNA序列数据涌现出来，为研究在基因组中寻找水平转移基因提供了极大的便利．将基因序列特征分析和支持向量机技术结合起来，通过分析基因序列的特征差异发现水平转移基因．依据以前研究工作的基础，选取了绝对密码子使用频率（FCU）作为序列特征，主要因为它既包含了基因密码子使用偏性的信息，也包含了基因所编码蛋白的氨基酸组成信息，支持向量机利用这些信息进行水平转移基因分析和预测，可以提高预测的准确性．另外，提出了基于分链的水平转移基因预测新方法，即将细菌基因组前导链和滞后链上