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在1998－1999年间用PFU微型生物群落来监测和评价黄浦江不同样点的水质情况，结合微型生物的种类数，种类丰度指数，种类多样性指数；及群落结构中的动鞭虫比值和纤毛虫比值等指标建立了综合的评价指标，并应用指标对黄浦江1998－1999年水质情况进行了综合评价，这一评价结果是同期的理化分析评价结果基本一致，表明用该体系来评价黄浦江的水质是可行的。