基于线粒体cox1基因序列云南省大理白族自治州亚洲带绦虫遗传多样性分析

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目的 了解云南省大理白族自治州亚洲带绦虫的群体结构。方法 对从大理白族自治州大理市、弥渡县、洱源县和漾濞彝族自治县采集的66份亚洲带绦虫样品,利用聚合酶链式反应(PCR)技术扩增其cox1基因部分序列。使用DNASP 5.10.01和MEGA 7.0等软件对所得序列进行分析,得到片段碱基含量、遗传距离以及遗传多样性参数等数据,并通过构建系统发育树的方式,结合遗传多样性数据进行分析。结果 获得的66条亚洲带绦虫cox1基因片段大小均为510 bp,共有89个变异位点,平均A、T、C、G的碱基含量分别21.3%、48.4%、10.0%和20.3%;比对发现,66条基因序列共形成21个单倍型,核酸多样性和单倍型多样性分别为0.084 4和0.839;总群体Tajima′s D检验值为显著负值;遗传距离为0.000 66~0.087 85,大理市群体与漾濞县群体之间的遗传距离最大。结论 大理白族自治州亚洲带绦虫线粒体cox1基因具有丰富的遗传多样性,本研究为亚洲带绦虫的遗传多样性研究提供了基础数据。
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