【摘 要】
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目的 分析肝细胞癌组织和肝癌癌旁组织中乙肝病毒X区基因,了解其变异情况.方法 采用巢式PCR对100份肝细胞癌组织和100份肝癌癌旁组织中X基因进行扩增,并对扩增成功的基因进行测序和序列分析.结果 100份肝癌组织和100份肝癌癌旁组织中X基因检出率分别为29.0％(29/100)、27.0％ (27/100),所得序列与参考序列(AY518556)的一致性介于62.37％～99.14％,共发现88个位点(88/465,18.90％)发生不同频率的点突变,呈散在分布,并检出多个热点突变类型A1762T、G
【机 构】
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深圳市盐田区人民医院检验科,广东深圳518081;中南大学湘雅医学院检验科,湖南长沙410013;邵阳学院护理学院,湖南邵阳422000
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目的 分析肝细胞癌组织和肝癌癌旁组织中乙肝病毒X区基因,了解其变异情况.方法 采用巢式PCR对100份肝细胞癌组织和100份肝癌癌旁组织中X基因进行扩增,并对扩增成功的基因进行测序和序列分析.结果 100份肝癌组织和100份肝癌癌旁组织中X基因检出率分别为29.0％(29/100)、27.0％ (27/100),所得序列与参考序列(AY518556)的一致性介于62.37％～99.14％,共发现88个位点(88/465,18.90％)发生不同频率的点突变,呈散在分布,并检出多个热点突变类型A1762T、G1764A、C1653T、C1766T和T1768A.测序成功的组织中有4份HBV X基因存在共同缺失突变,缺失位置在HBx核苷酸位置HBV nt1445-1609,缺失片段长度为165 bp,并伴有4个共同点突变G1401T/T1678C/G1686A/G1752A,将该特征性突变命名为HBx-d71.HBx核苷酸位置nt1593缺失了A,导致开放阅读框的漂移;nt 1679-1708和nt1778-1798分别存在插入突变(30 bp)和缺失突变(21 bp).检出的HBV基因型有10份B基因型和3份C基因型,与B基因型相比,C基因型有更高的点突变数(t=-16.36,P=0.000).结论 HBV X基因的突变类型复杂且多变,新的突变类型还需进一步研究以确定其与肝癌的关系及其生物学功能.
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