【摘 要】
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以蛹虫草(Cordyceps militaris)核基因组和线粒体基因组数据为基础,对密码子使用偏性及其影响因素进行分析。结果显示:蛹虫草核基因的GC含量为59.53%,同义密码子第3位胞嘧啶
【机 构】
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曲靖师范学院生物资源与食品工程学院
【基金项目】
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国家自然科学基金(31860005、32060710),云南省地方本科高校基础研究联合专项(202001BA070001-002)
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以蛹虫草(Cordyceps militaris)核基因组和线粒体基因组数据为基础,对密码子使用偏性及其影响因素进行分析。结果显示:蛹虫草核基因的GC含量为59.53%,同义密码子第3位胞嘧啶频率最高(50.58%),高表达基因的平均有效密码子数较低;核基因中共鉴定出22个高频密码子,均以G/C结尾,其中16个为最优密码子,且81.25%的最优密码子以C结尾;基因表达与有效密码子数、第3位同义密码子C的频率显著相关;核基因密码子偏性较强,低表达基因主要受碱基突变影响,而高表达基因主要受选择压力影响。线粒体
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