肌肉减少症相关致病基因的生物信息学

来源 :中华骨质疏松和骨矿盐疾病杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户：hjx1000000

【摘要】

：

目的利用生物信息学方法探索有关肌肉减少症(简称肌少症)的生物调控因子及信号通路。方法从美国国立生物技术信息中心基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)下载肌少

【作者】

：

王莉华辛宁连晓宇林帆

【机构】

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福建医科大学省立临床医学院,福建省立医院老年科

【出处】

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中华骨质疏松和骨矿盐疾病杂志

【发表日期】

：

2021年2期

【关键词】

：

肌肉减少症生物信息学差异表达基因 SLPI GADD45G

【基金项目】

：

福建省立医院“创双高”火石(科研培育)基金(2019HSJJ17)。

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目的利用生物信息学方法探索有关肌肉减少症(简称肌少症)的生物调控因子及信号通路。方法从美国国立生物技术信息中心基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)下载肌少症相关数据集GSE1428及GSE8479,利用Perl软件将数据集合并,R软件筛查老年肌少症患者骨骼肌与青年人骨骼肌间差异表达的基因。利用在线工具DAVID进行基因本体论及京都基因和基因组百科全书通路富集,使用STRING数据库进行差异编码蛋白的相互作用分析。结果基因表达量以log2差异倍数(log|FC|)>

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