【摘 要】
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本文利用ITS2序列及其二级结构对传统中药材牛尾独活、当归、独活和羌活进行分类鉴定。通过GenBank数据库中下载牛尾独活等药材共7个物种26条ITS序列,采用隐马尔可夫模型注释获得ITS2序列。采用MEGA软件计算种内、种间K2P遗传距离,构建NJ系统发育树。同时利用ITS2 Database预测各样本ITS2二级结构,并利用4Sale软件比对一级结构和二级结构的联合矩阵,最终采用ProfDistS软件基于距离法构建PNJ进化树。结果表明,各样本种间平均遗传距离均远大于种内平均遗传距离,各药材间存在明显
【机 构】
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西安医学院药学院,陕西中医药大学药学院,咸阳师范大学化学与化工学院
【基金项目】
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陕西省自然科学基础研究计划项目(2021JQ-782),西安医学院2018年校级基金(2018DXS2-10,2018DXS2-13)。
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本文利用ITS2序列及其二级结构对传统中药材牛尾独活、当归、独活和羌活进行分类鉴定。通过GenBank数据库中下载牛尾独活等药材共7个物种26条ITS序列,采用隐马尔可夫模型注释获得ITS2序列。采用MEGA软件计算种内、种间K2P遗传距离,构建NJ系统发育树。同时利用ITS2 Database预测各样本ITS2二级结构,并利用4Sale软件比对一级结构和二级结构的联合矩阵,最终采用ProfDistS软件基于距离法构建PNJ进化树。结果表明,各样本种间平均遗传距离均远大于种内平均遗传距离,各药材间存在明显
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