【摘 要】
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目的通过对癌症基因组图谱(TCGA)数据库中胃腺癌转录组数据进行分析,找出预后相关的差异表达基因。方法从TCGA数据库中下载胃腺癌的转录组数据,利用R语言edgeR包筛选出差异基
【机 构】
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首都医科大学附属北京友谊医院肿瘤中心,首都医科大学附属北京友谊医院消化内科
【基金项目】
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国家自然科学基金(编号:81670474),北京市自然科学基金(编号:7172061).
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目的通过对癌症基因组图谱(TCGA)数据库中胃腺癌转录组数据进行分析,找出预后相关的差异表达基因。方法从TCGA数据库中下载胃腺癌的转录组数据,利用R语言edgeR包筛选出差异基因后,对差异基因进行生存分析。结果共得到175个差异表达miRNA及201个差异表达mRNA/lncRNA,进一部进行生存分析,以P<0.05作为统计筛选标准,得到15个miRNA和9个mRNA、8个lncRNA与胃癌的生存时间相关。结论通过对TCGA数据库中胃腺癌的表达数据进行分析研究,选出与该病预后密切相关的基因,为该病
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