为了评估转基因大豆向野大豆（Glycine soja Sieb. et Zucc.）基因漂移后可能产生的生态风险，选取抗草甘膦转基因大豆（携带外源基因cp4-epsps）与野大豆（来自内蒙古包头）杂交F2代种皮颜色为黑色、褐绿色和褐黄色（与野大豆种皮颜色相近）的种子，对这些种子萌发产生的F3代植株的19个定量性状和5个定性性状进行分析，在此基础上，将F3代植株及其亲本进行聚类分析，并对不同组F3代的定量和定性性状进行分析。结果显示：F3代幼苗中抗性植株与非抗性植株的分离比符合“5∶1”的孟德尔遗传定律。定量性状中，结实率的变异系数最小（4.65%）,其余18个性状的变异系数高于14%,其中，单株种子数的变异系数最大（55.68%）。不同种皮颜色F2代种子萌发产生的F3代植株均以强缠绕型占比最高；F3代植株中，90.7%的果荚为弯镰形或弓形，且80.0%的果荚颜色为黑褐色；黑色种皮F2代种子萌发产生的F3代种皮颜色无性状分离，褐绿色和褐黄色种皮F2代种子萌发产生的F3代种皮颜色均出现性状分离；F3代种子中，82.7%的种子有泥膜。聚类结果显示F3代植株被分为3组。不同组F3代中，Ⅰ组的多数性状最低，且株高等5个性状显著低于野大豆；Ⅱ组的9个性状最高，且单株结荚数等15个性状显著高于野大豆，仅株高显著低于野大豆；Ⅲ组的部分性状最高，且单株结荚数等12个性状显著高于野大豆，株高等3个性状显著低于野大豆。综合比较认为，Ⅱ组的竞争能力最强，Ⅰ组的竞争能力最弱。Ⅰ组的不缠绕型植株占比最高，而Ⅱ和Ⅲ组的强缠绕型植株占比最高。3组F3代的种皮颜色均以黑色占比最高。综上所述，供试的不同组F3代植株均能完成生活史并产生后代。若抗草甘膦转基因大豆的基因通过花粉漂移到野大豆上并成功杂交，则会产生不同适应性杂交后代，增加生态风险。