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随着大规模技术的进步，收录到数据库中的序列很快，其中大多是未知功能的ＥＳＴｓ（表达序列标签，Ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ｔａｇｓ），一般通过蛋白南－ＥＳＴ序列联配来实验ＥＳＴ的功能提示。由于ＥＳＴ含有５％左右的误差，特别严重的是其中的移框误差，用通常的方法将ＥＳＴ按６个框翻译为蛋白南序列再进行联配难以处理移框误差问题。通过考虑ＥＳＴ序列各种可能的误差，将氨基酸序列反翻译为核苷酸序列，在核