新城疫病毒F基因重要功能区和HN基因单核苷酸多态性研究

来源 :中国家禽 | 被引量 : 0次 | 上传用户：liongliong583

【摘要】

：

对广泛应用的新城疫疫苗株La Sota进行了全基因组测序,并对来自9个不同基因型新城疫病毒株的血凝素神经氨酸酶(haemagglution-neuraminidase,HN)基因和融合蛋白(fusion prote

【作者】

：

张晓东刘怀然刘培欣刘胜旺孔宪刚

【机构】

：

中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室禽传染病研究室

【出处】

：

中国家禽

【发表日期】

：

2004年期

【关键词】

：

新城疫病毒 F基因 HN基因单核苷酸多态性选择压力

【基金项目】

：

国家科技支撑计划;

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对广泛应用的新城疫疫苗株La Sota进行了全基因组测序,并对来自9个不同基因型新城疫病毒株的血凝素神经氨酸酶(haemagglution-neuraminidase,HN)基因和融合蛋白(fusion protein,F)基因47～435 nt区域进行了用单核苷酸多态性(SNP)分析.结果表明:在F基因47～435nt间和HN基因中都存在高密度的SNP位点,Tajimas D检验结果表明这些核苷酸变化符合中性突变假说,Pi(a)/Pi(s)分析暗示F蛋白编码基因N端的一些区段和HN蛋白编码基因中散在的部分区域受到了正向选择.但F基因和HN基因在整体上却都受到了强大的负向选择压力的影响.

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