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期刊论文
DNA序列比对数目的算法研究
DNA序列比对数目的算法研究
来源 :大学数学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:roseisdead
【摘 要】
:
生物序列比对是生物信息学中非常重要的内容,文[1]中作者用差分方程理论给出了求两DNA序列间比对数目的一个计算公式,然而解法较为繁琐.本文将借助于组合数学中母函数这一计数工
【作 者】
:
徐琛梅
刘晓杰
【机 构】
:
河南大学数学与信息科学学院,南开大学组合数学中心
【出 处】
:
大学数学
【发表日期】
:
2008年1期
【关键词】
:
DNA序列
序列比对
母函数
非生物比对
DNA sequence
Alignment
Generating function
No-biological
【基金项目】
:
新世纪高等教育教学改革工程本科教育教学改革立项项目(编号1283801071)
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生物序列比对是生物信息学中非常重要的内容,文[1]中作者用差分方程理论给出了求两DNA序列间比对数目的一个计算公式,然而解法较为繁琐.本文将借助于组合数学中母函数这一计数工具给出另一简单、优美的算法,并在此基础上剔除非生物比对,得到进一步的计算公式,这一结果缩小了需要考查的比对范围。
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