系统生物模型转换研究——从SBML到Stochastic Pi Calculus

来源 :上海交通大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：wxlcc1026

【摘要】

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分析了系统生物标记语言(SBML)模型和用随机Pi演算对生物建模(BioSPI)的不同特点,给出了两种模型之间转换的一系列处理规则;在规则的指导下将具体的SBML模型转换为BioSPI表示

【作者】

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董驻鹏董笑菊倪佳华

【机构】

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上海交通大学

【出处】

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上海交通大学学报

【发表日期】

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2005年8期

【关键词】

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系统生物系统生物标记语言随机Pi演算对生物建模形式化方法 DNA计算机 systems biology systems biology markup la

【基金项目】

：

国家自然科学基金，上海市科委资助项目

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分析了系统生物标记语言(SBML)模型和用随机Pi演算对生物建模(BioSPI)的不同特点,给出了两种模型之间转换的一系列处理规则;在规则的指导下将具体的SBML模型转换为BioSPI表示的程序语言,并借助分析工具来模拟该SBML模型运动变化过程.提出了自动实现转换的方法以及将转换扩展到其他进程演算形式的构想.

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