【摘 要】
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目的:利用TCGA筛选与癌不良预后相关的特异性基因.方法:从TCGA数据库下载胃癌及癌旁组织mRNA表达谱数据及相应的临床资料.应用“edgeR”R包筛选出癌组织中较癌旁组织高表达的
【机 构】
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安徽医科大学第一附属医院 安徽合肥 230031
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目的:利用TCGA筛选与癌不良预后相关的特异性基因.方法:从TCGA数据库下载胃癌及癌旁组织mRNA表达谱数据及相应的临床资料.应用“edgeR”R包筛选出癌组织中较癌旁组织高表达的基因(log2(Foldchang)>1,pValue<0.05).接着利用Veen图获取在胃癌组织中高表达并且与Stage成正相关的基因.最后探究核心基因与胃癌患者不良预后的关系.结果:Veen图结果显示总共有73个基因在胃癌中较癌旁组织高表达.生存曲线结果显示,VCAN和C3在胃癌中的高表达与病人的不良预后显著相关.结论:筛选出与胃癌发生、发展及不良预后密切相关的关键基因,可作为新的潜在的治疗靶点和检测预后的生物标志物.
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