环泰山区域鼠类与人恙虫病东方体基因同源性和系统进化树分析

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[目的]了解环泰山区域恙虫病东方体(Ot)流行株的基因型、遗传特征,探讨人、鼠间所感染Ot的基因同源性和系统进化情况。[方法]2006~2008年对在环泰山区域采集的鼠类和疑似恙虫病病人标本进行Ot-Sta56kDa基因片段检测,对阳性标本进行序列测定;对所测到的序列与GenBank中部分Ot参考序列进行序列同源性分析,绘制系统发生树。[结果]检测84份鼠脾标本,4份Ot基因阳性,阳性率为4.76%。其中,家鼠阳性率为1.79%,黑线姬鼠阳性率为10.71%(P>0.05)。4份病人焦痂标本3份Ot基因阳性。序列同源性分析显示,鼠脾标本08P、53P的核苷酸序列与Sdu-1型同源性为99.77%,与Taguehi和Oishi型的同源性均为95.98%,与Kanda和Kawasaki型的同源性均为95.74%;鼠类标本55P、56P的核苷酸序列与TA686型的同源性分别为86.27%和77.11%。3份病人阳性标本的核苷酸序列与鼠标本08P、53P同源性均为100.00%,与55P、56P的同源性仅为74.30%。系统发生树分析显示,08P、53P和3份病人阳性标本与Sdu-1型在同一分支,与Kawasaki、Kanda、Tagnchi和Oishi型共处于同一分支;55P和56P与TA686型在同一分支。[结论]环泰山区域人、鼠间均存在Ot自然感染,病人Ot与部分鼠类感染Ot基因同源,Ot的基因型较为复杂。
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