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在系统仿真综合评估中，因素权重的确定至关重要。首先分析了在系统仿真综合评估中因素权重确定的常用方法，归纳了采用的步骤。针对常用方法存在的主观因素影响较大和工程应用中不易组织实施两方面不足，从灰色系统角度对仿真系统进行分析，进而介绍了灰色关联分析法及基于该法进行关联度的计算和权重确定的步骤，最后在某仿真系统中进行应用并对比分析采用常用方法得到的结论。结果表明，使用此法方便、简捷，可靠性高，在系统综合评估中权重的确定上具有较高的应用价值。