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在被动型原子频标中,由于相位延时及系统驰豫时间的影响,给伺服环路的同步鉴相环节带来不便,进而会影响系统的指标。从整机系统中参与同步鉴相的两路低频方波信号出发,通过综合器模块中的DDS的FSK模式来调整两路方波信号的相位,使其满足同步鉴相的要求,并给出了调整后系统稳定度指标改善的实验结果。