鸭圆环病毒基因序列测定与分析研究

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应用PCR方法从临床健康鸭脾脏样品中分段扩增获得鸭圆环病毒(Duck circovirus,DuCV)TD/41/09株全长基因组。测序结果表明,TD/41/09基因组全长为1994bp,含有4个开放阅读框(ORF),其中V1和C1是主要的2个ORF,分别编码Rep蛋白和Cap蛋白;在V1和C1的5′端之间存在与启动滚环复制有关的1个茎环结构和2个正向重复序列。遗传进化分析发现,TD/41/09与Ger(德国分离株)、LZ1109(广西分离株)、MH25(福建分离株)、33753-52(美国分离株)同处一个进化分支,而与PT07(福建分离株)、WS-GD010(广东分离株)和TC1/2002(台湾分离株)关系较远。
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