目的比较荧光定量PCR法(RT-PCR)和原位杂交法检测头颈部鳞状细胞癌中HPV(HPV)16/18亚型感染的差异。方法采用RT-PCR法和原位杂交法对78例头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤组织进行HPV感染状态的检测,评价两种方法的一致性。结果 RT-PCR法检测到62.8%的头颈部鳞癌组织中含有HPV16/18 DNA。原位杂交法检测到47.4%的肿瘤组织中有HPV16 DNA。用RT-PCR方法,唇、口腔、口咽及下咽的HPV16/18 DNA阳性率分别为33.3%、66.67%、70%和57.14%;用原位杂交方法,唇、口腔、口咽、下咽的HPV16 DNA阳性率分别为33.3%、43.8%、60.0%和57.1%。总体上,两种方法检测HPV16/18DNA具有较高一致性(Kappa=0.595,P<0.001)。结论 RT-PCR和原位杂交法检测HPV16/18 DNA结果的一致性较高。