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动物检疫作为动物防疫工作的重要组成部分，为预防、控制动物疫病，防止其传播、扩散和流行起着关键作用。但是，由于动物检疫工作具有法律性、技术性和强制性，再加上舟山地区动物饲养分散，畜禽流转频繁，使原本艰巨的检疫工作难度加大。为强化动物检疫工作，舟山市畜牧兽医行政管理部门积极推进、深化畜牧兽医体制改革，但在基层工作职能定位、管理方式方法、队伍整体素质等方面还受诸多因素制约。