估算转轨成本对于实施中国公共部门并轨改革有着重要意义。在考虑国外养老金改革经验和中国公共部门的特殊特点的基础上,利用2010年全国第六次人口调查相关数据,测算了政府机关和事业单位养老金转轨成本。若政府于2010年按照企业职工缴费标准一次性做实改革世代的养老金账户,则需为政府机关公务员补缴养老金约3.9万亿元,为事业单位工作人员补缴约5.2万亿元,共计约9.1万亿元。若政府在改革世代养老金到期支付时才承担支出责任,则在社会平均工资50%的保障水平等假定下,2011-2085年期间每年转轨成本占GDP的比例最高不超过0.7%,占财政收入的比例最高不超过6%;若按4%的折现率折现至2010年,则规模达2010年GDP的34%,2010年财政收入的166.37%。因此,公共部门养老金双轨制并轨改革虽然成本规模总体可控,但如不采取适当措施消除转轨成本,并轨后的中国公共部门养老金缺口将对社会养老金体系的严峻形势带来更大挑战。