【摘 要】
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为了解龙眼ERF家族的基本性质以及在体胚发生早期的表达规律,该研究对龙眼基因组鉴定出108个ERF家族成员进行基本理化性质分析与进化树构建,并结合龙眼转录组及miRNA、lncRNA
【机 构】
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福建农林大学园艺植物生物工程研究所
【基金项目】
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国家自然科学基金(31572088,31672127);福建省自然科学基金杰出青年项目(2015J06004);福建农林大学科技创新专项基金(KF2015108,CXZX2017314,CXZX2016118,CXZX2016119,CXZX2017189,CXZX2017351)
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为了解龙眼ERF家族的基本性质以及在体胚发生早期的表达规律,该研究对龙眼基因组鉴定出108个ERF家族成员进行基本理化性质分析与进化树构建,并结合龙眼转录组及miRNA、lncRNA数据库对DlERF家族成员与lncRNA、miRNA之间的关系预测与表达模式分析。结果显示:(1)理化性质及进化树分析表明,AP2/ERF结构域在龙眼中相对最为保守,DlERF对龙眼的抗胁迫能力以及对病菌的防御能力可能起着重要作用。(2)RNA-Seq中的表达量分析可知,95个ERF基因在转录组中检测到表达,在愈伤组织(EC)
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