狂犬病病毒核蛋白基因生物信息学分析

来源 :上海畜牧兽医通讯 | 被引量 : 0次 | 上传用户:glory001
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本研究对狂犬病病毒(rabies virus,RV)CVS株核蛋白基因进行了克隆与测序,推导出相应的氨基酸序列.然后采用Gamier-Robson方法和Chou-Fasman方法预测了蛋白的二级结构,用Kyte-Doolittle方法对蛋白的亲水性进行了分析,用Emini方法预测了蛋白的表面可能性,以Jameson-Wolf方法预测了蛋白的抗原指数.然后综合分析预测蛋白的B细胞抗原表位.结果表明,核蛋白序列的143-152、166-172、263-273、411-427区域或其附近最有可能是B细胞抗原表位的优势区域.本结果为狂犬病反向疫苗学的研究提供了一定的理论依据.
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