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利用植原体16S rDNA通用引物对水稻橙叶病发病植株的DNA进行了PCR扩增和基因克隆．序列测定表明，PCR扩增的片段全长为1853bp，包括1527bp的水稻橙叶病植原体（RYL）的16S rDNA基因全序列、234bp的邻近间隔区的序列及部分（92bp）23S rDNA基因序列．序列比较结果表明，RYL的16S rDNA全序列与其他植原体的相似性在88％～95％，其中与America aster yellows（AAY，GenBank登录号X68373）最高相似性为95％．利用最大简约法构建的16S