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自本科生导师制在我国普遍实施以来，取得了良好成效的同时面临着导师、学生和学校三个方面的困境，本文通过分析本科生导师制实施所出现的困境，结合第三军医大学的具体实施办法进一步阐明本科生导师制在课堂之外为学生提供了与导师交流指导，进行科学研究探索，熟悉实验技术操作的机会，有效地提高了医学本科生的综合素质。