副溶血性弧菌16SrRNA基因序列变异规律分析

来源 :食品与生物技术学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:flurryzhang
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通过对副溶血性弧菌16S rRNA基因序列进行深度分析,研究其序列变异特点,为开发新的分型溯源靶点奠定基础。对111株分离自生鲜水产品的副溶血性弧菌16S rRNA基因测序,与GenBank中已有的副溶血性弧菌16S rRNA基因标准序列比对分析,对变异度比较大的序列建立了系统发育树,深入分析了基因的变异规律,并使用ERIC-PCR方法加以验证。不同副溶血性弧菌菌株16S rRNA基因变异主要集中在可变区V1和V2区,50-270 bp的区域内有38个碱基的相似度小于30%,103个碱基的相似度在30%-
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