经济技术开发区和改革开放相伴而生,对中国的经济社会发展和改革开放起到了重大作用。但是由于公共利益和自身利益的冲突,由于现有体制下的考核体系不完善,经济技术开发区的发展过程中存在着悖论。一是规模和功能的悖论:经济技术开发区的功能并没有随着规模扩张而提升,经济增长的带动效应逐步弱化,服务功能发育缓慢。二是体制创新和回归的悖论:为了保证自身利益的最大化,经济技术开发区在推进体制创新的过程中却逐步向旧体制回归。三是市场分割和融合的悖论:经济技术开发区作为市场经济体制为导向的改革的重要制度安排本应该促进市场的融合,而在实践过程中却形成了市场的分割。四是产业集聚和企业扎堆的悖论:经济技术开发区利用优惠政策促进了企业扎堆,但并没有形成产业集群。五是开放和封闭的悖论:经济技术开发区本来是对外开放的产物,但在现实发展中却走上了封闭的道路。如果不解决发展过程中的悖论,加快转型,经济技术开发区在后续的发展中就难以发挥自身的功能。