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云南省合龙寨铅锌矿区的主要赋矿层位为中元古界昆仑群大龙口组及美党组。该区岩浆活动频繁，自元古代晚期至新生代，其构造运动存在强度不等、类型不同的几期岩浆侵入，与成矿关系最为密切的是燕山早期Ⅱ亚期侵入岩一岔河岩体（ηγ^2b5）。合龙寨主体构造形态为向斜，其向斜核部及两翼地层被后期岩浆侵入体严重改造，而花岗岩体中发育的断裂构造控制了该矿区的矿体富集程度。据此认为该区矿体分布及组合是岩浆岩、地层和构造等因素综合作用的结果，属中温到中低温热液交代裂隙充填矿床。根据该区的主要成矿特点，提出了下一步的主要勘查方向。