【摘 要】
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目的 基于细胞焦亡与炎症反应相关基因构建肝细胞癌预后风险评估模型,并进一步探索该模型对肿瘤免疫微环境状态的预测效能,为制定个性化的治疗方案提供方向.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库(365例)和国际癌症基因组联盟(ICGC)数据库(231例)下载有关肝细胞癌样本的细胞焦亡和炎症反应基因的mRNA数据,通过Lasso Cox回归分析构建肝细胞癌预后风险评估模型,计算细胞焦亡与炎症反应评分(PIRS).采用R语言进行生存预后分析及临床病理特征分析;单样本基因集富集分析(GSEA)以及肿瘤免疫功能障碍与
【机 构】
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212000 镇江,江苏大学附属医院肿瘤科;温州医科大学第一临床医学院
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目的 基于细胞焦亡与炎症反应相关基因构建肝细胞癌预后风险评估模型,并进一步探索该模型对肿瘤免疫微环境状态的预测效能,为制定个性化的治疗方案提供方向.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库(365例)和国际癌症基因组联盟(ICGC)数据库(231例)下载有关肝细胞癌样本的细胞焦亡和炎症反应基因的mRNA数据,通过Lasso Cox回归分析构建肝细胞癌预后风险评估模型,计算细胞焦亡与炎症反应评分(PIRS).采用R语言进行生存预后分析及临床病理特征分析;单样本基因集富集分析(GSEA)以及肿瘤免疫功能障碍与逃逸预测肿瘤免疫微环境状态;GSEA分析PIRS相关的信号通路及生物学功能.结果 TCGA数据库中64个基因与肝细胞癌患者的总生存期有关(P<0.05),筛选出15个基因构建肝细胞癌预后风险评估模型.Kaplan-Meier生存分析显示,高风险组的总生存期较低风险组短(P<0.01).TCGA数据库中PIRS的AUC在1、2和3年时分别为0.871、0.846和0.831,ICGC数据库中AUC分别为0.844、0.733和0.751.PIRS是肝细胞癌患者预后的独立预测指标(HR=2.802,95％CI:2.286～3.433,P<0.01).高风险组中免疫杀伤细胞含量、细胞毒反应和干扰素活性均低于低风险组(均P<0.01),但巨噬细胞含量、免疫功能障碍评分和T细胞驱逐评分均高于低风险组(均P<0.01).高风险组中富集了细胞周期、血管内皮生长因子和转化生长因子β等相关信号通路.结论 PIRS与肝细胞癌患者预后有关,高风险组处于免疫抑制状态,肝细胞癌预后风险评估模型能准确预测患者预后.
其他文献
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