【摘 要】
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[目的]探究三七不同部位内生细菌群落多样性.[方法]采用高通量测序技术对三七内生细菌16SrRNA基因V5～V7区进行序列测定,并对三七不同部位内生细菌多样性进行生物信息学分析.[结果]在三七的根、茎和叶中分别获得了 385、206和226个OTU,3个部位中相同的OTU数为167个,占比19.04％.归类物种分类结果表明,叶部内生细菌种类归属于16门27纲74目134科222属,优势属为Cutibacterium和劳尔氏菌属(Ralstonia),分别占28.70％和14.57％;茎部内生细菌种类归属于
【机 构】
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昆明学院农学与生命科学学院/云南省高校生物炭工程研究中心,云南昆明 650214;云南大学医学院,云南昆明 650091
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[目的]探究三七不同部位内生细菌群落多样性.[方法]采用高通量测序技术对三七内生细菌16SrRNA基因V5～V7区进行序列测定,并对三七不同部位内生细菌多样性进行生物信息学分析.[结果]在三七的根、茎和叶中分别获得了 385、206和226个OTU,3个部位中相同的OTU数为167个,占比19.04％.归类物种分类结果表明,叶部内生细菌种类归属于16门27纲74目134科222属,优势属为Cutibacterium和劳尔氏菌属(Ralstonia),分别占28.70％和14.57％;茎部内生细菌种类归属于12门20纲58目108科178属,优势属为假单胞菌属(Pseudomonas),占45.50％;根部内生细菌种类归属于19门24纲75目137科202属,优势属为 Burkholderia-Caballeronia-Paraburkholderia 和埃希氏-志贺菌属(Escherichia-Shigella),分别占24.78％和21.94％.从整体结果看,根部物种的丰度高于茎部和叶部.[结论]三七不同部位的内生细菌含有丰富的群落多样性,但不同部位的丰度不同,整体表现为根＞叶＞茎,且各部位的优势属并不相同,部分优势属细菌具有一定的功能作用,可进一步的开发利用.通过对三七不同部位内生细菌多样性进行研究,为后续筛选生防菌株奠定基础.
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