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同源或非同源长基因组序列的分析比较需要高效率的比对算法。开发出一个新的两两比对工具“超级压缩比对”（简称SCA），该系统是建立在Sequitur编码理论专为长基因组序列的两两比对设计。SCA是一个线性算法，并且能够处理序列重排。实验证明SCA算法能够准确快速的完成长基因组序列的比对。
数据压缩在序列比对中的应用
【摘 要】
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同源或非同源长基因组序列的分析比较需要高效率的比对算法。开发出一个新的两两比对工具“超级压缩比对”（简称SCA），该系统是建立在Sequitur编码理论专为长基因组序列的两两比
【机 构】
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天津城市建设学院
【出 处】
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计算机工程与应用
【发表日期】
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2008年22期
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