暗紫贝母中法呢基焦磷酸合酶的生物信息学分析

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以暗紫贝母的法呢基焦磷酸合酶氨基酸序列为研究对象,利用CDsearch、ProtParam和SignalP等13种在线预测软件对其保守区域、理化性质、亚细胞定位、亲疏水性、二级结构、三级结构等性质进行分析.结果发现,该酶由352个氨基酸残基组成,是一种不含信号肽不跨膜、定位于线粒体基质的可溶性亲水蛋白,具有典型的类异戊二烯合成酶超家族结构域.其二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲组成.三级结构以PDBID4kk2.1为模板建模,包含两个聚异戊烯合酶位点,200Lys为其结合配体Mg2+的结合位点,活性区域由
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