一株类志贺邻单胞菌噬菌体生物学特性及全基因组分析

来源 :微生物学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:renbai
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[目的]多重耐药菌株的出现给食品安全带来严重威胁.噬菌体是不同于抗生素的一类重要杀菌因子,对其生物学特性及基因组的研究和分析可为噬菌体的抗菌应用提供依据.[方法]对噬菌体phiP4-7的生物学特性、基因组学、分类学进行研究.[结果]经透射电子显微镜观察,确定phiP4-7头部直径为(50.59±1.68) nm,尾部长度为(76.53±4.90) nm,属于长尾噬菌体科;一步生长曲线结果表明,其潜伏期时间约为25 min,每个感染中心释放的噬菌体数量约为63 PFU/infection center;抑菌曲线结果表明,phiP4-7能够有效地抑制宿主菌的生长.基因组测序组装结果显示,phiP4-7基因组长度为39825 bp,GC含量为48.67%.通过生物信息学软件对基因组进行注释,发现phiP4-7的基因组上共编码72个蛋白,不编码tRNA基因,未发现已知的耐药基因和毒力基因.比较基因组学和分类学结果显示,将其归类为长尾噬菌体科中的一个新属.[结论]分离得到了一株新类志贺邻单胞菌噬菌体,并对其生物学特性和基因组进行了分析.
其他文献
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[背景]广泛存在于革兰氏阴性菌和革兰氏阳性菌中的自诱导物autoinducer-2 (AI-2)能够介导细菌种内和种间通讯,并调节细菌的多种生理过程.然而恶臭假单胞菌KT2440能否感知AI-2信号还未见报道.[目的]挖掘介导恶臭假单胞菌KT2440对AI-2趋化反应的趋化受体,检测AI-2信号通过趋化受体对恶臭假单胞菌KT2440生物膜形成的调控作用.[方法]本研究首先检测恶臭假单胞菌KT2440对AI-2信号的趋化反应,随后表达纯化了与铜绿假单胞菌AI-2受体高度同源的甲基化趋化受体McpU的配体结合
[目的]探究猪丁型冠状病毒(porcine deltacoronavirus,PDCoV)能否在不同动物源性细胞系中感染和增殖.[方法]本研究将PDCoV四川分离株CHN-SC2015接种来自仓鼠、家禽、猴、人和猪的12种细胞系,将病毒在每种细胞系中盲传至少5代并通过逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)、实时荧光定量PCR (RT-qPCR)、间接免疫荧光试验(IFA)和测序鉴定.[结果]PDCoV在Vero、PAM、PK15、ST和LLC-PK1细胞中的P1表现出明显的细胞病变效应(CPE),且在PA
[目的]对西藏松萝地衣来源的两株非常规酵母进行分离鉴定,并通过基因组序列分析探究其生物学特性和应用潜力.[方法]从西藏来源的松萝地衣样品内部分离得到2株耐低温酵母菌株,通过26S D1/D2和ITS序列比对分析以及生理生化实验进行菌种鉴定;通过全基因组序列分析和验证探究菌株的生物特性.[结果]两株酵母菌株经鉴定均为Curvibasidium rogersii,可以在10℃低温良好生长,在20℃生长最佳,25℃及以上温度生长缓慢或不生长.对其进行基因组测序和基因组挖掘,测序结果发现,其基因组注释出功能的部分
[背景]石油污染治理中的生物修复因无二次污染、处理成本低等优点受到人们的广泛关注,但由于石油烃向环境中大量输入,导致环境中氮源的相对不足成为制约生物修复效率的关键因素之一,因此筛选能够适应寡氮环境的微生物具有重要的生态意义.[目的]从辽河油田油藏水中筛选在不添加氮源培养基中生长的微生物,为石油污染环境生物修复提供候选菌株.[方法]利用改良无氮培养基分离菌株,根据16S rRNA基因序列同源性鉴定菌株,并对其进行固氮酶活性分析、固氮基因和石油降解基因扩增.[结果]筛选得到21株菌,分属于16个不同的属,其中
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[目的]通过对蜜环菌(Armillaria mellea)的富硒驯化,研究各菌株硒耐受性、有机硒含量及生物活性的变化规律,从而获得生物活性更强的蜜环菌,并对富硒蜜环菌的生物学特征进行初步研究.[方法]以Na2SeO3为无机硒试剂对蜜环菌进行富硒驯化;采用氢化物原子荧光光谱法测定蜜环菌的硒含量,热水浴法测定蜜环菌的无机硒含量;根据形态学、生理生化特征筛选优良的蜜环菌菌株.[结果]蜜环菌对无机硒有较好的富集能力.菌株J-234对Na2SeO3的耐受浓度为100 mg/L,菌株M-H和A-10对Na2SeO3的
[背景]羊肚菌是全球广泛分布的物种,具有重要的经济和科研价值,其根际微生态系统各要素间的相关性研究相对较少.[目的]探究甘肃省不同地区野生羊肚菌根际土壤中细菌群落-土壤理化性质及细菌群落-酶活性相关性.[方法]采用Illumina MiSeq高通量测序技术,对细菌群落组成进行测量,进而分析其多样性,最终揭示细菌群落-土壤理化性质及细菌群落-酶活性相互关系.[结果]根际土壤pH值随海拔升高而降低,然而土壤中大量元素含量、微量元素含量及酶活性随采样点呈现无规则变化.变形菌门(Proteobacteria)和放
[目的]本文探究了3种室温保存剂和-80℃C冷冻保存对粪便样本中菌群结构的影响,为大规模、标准化的采样提供参考.[方法]本研究采集了5名健康志愿者的新鲜粪便作为测试样本,采用4种不同的保存方式保存:DETs室温保存、GITC室温保存、RNAlater室温保存和-80℃冷冻保存,在保存0、1、3、7、14、28 d后,采用高通量测序技术测定样本中微生物16S rRNA基因V3-V4区序列,通过比较不同保存剂、不同保存时间后的样本与新鲜样本的差异,分析保存剂和保存时间对粪便样本菌群组成及丰度的影响.[结果]5
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