【摘 要】
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序列比对工作属于生物信息学的基础性研究领域。由于它具有应用广泛、计算复杂以及海量数据等特点，加之现在高性能计算的兴起，使得近年来序列比对并行处理技术快速发展。首先介
【机 构】
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肇庆学院计算机学院,湖南大学信息科学与工程学院,国家超级计算长沙中心
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序列比对工作属于生物信息学的基础性研究领域。由于它具有应用广泛、计算复杂以及海量数据等特点，加之现在高性能计算的兴起，使得近年来序列比对并行处理技术快速发展。首先介绍了序列比对领域高性能计算的新进展，接着从体系结构特征入手对其研究进行分类，并对每类方法的实现细节和性能进行分析比较，从中不难看出访存控制、同步、数据交互以及算法可扩展性等问题均为目前基于异构系统的序列比对并行处理研究的关键点。最后，对该领域的未来研究方向进行了展望。
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