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为阐明凤鲚不同地理群体的遗传结构和进化关系，采用凤鲚长江（21尾）、闽江（22尾）和珠江（22尾）群体的线粒体DNA（mitochondrial DNA，mtDNA）的细胞色素b（cytb）基因片段序列进行分析。共获得3群体cyt b基因片断607 bp的一致序列。序列有102个变异位点，总变异率为16．8％，其中68个为简约位点。各单倍型的变异全部是转换或颠换，无插入和缺失。（A＋T）含量为57．6％，大于（G＋C）的含量42．4％。核苷酸多态性以闽江群体最高，其它两群体较低。自然选择检验显示3群体内部