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初生鸡苗常常感染沙门氏菌、大肠杆菌、绿脓杆菌、葡萄球菌、链球菌等细菌，造成发病死亡。这些细菌主要来源于种蛋和孵房两个方面。一方面种鸡感染后导致种蛋带菌，鸡胚孵化后期死亡或出壳雏鸡带菌。另一方面，绿脓杆菌、葡萄球菌、链球菌是环境中常见菌，在消毒不彻底的情况下污染蛋壳和孵房及其设备，造成鸡苗的感染。此外，育雏室环境污染、疫苗接种时针头消毒不严等也是鸡苗感染的原因。