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根据胶原蛋白分子的结构特点,建立了新的胶原蛋白分子模型,得到了更能体现胶原蛋白分子三维结构的系统哈密顿量,并采用4阶Runge-Kutta算法,对得到的电场作用下胶原蛋白分子中激发态能量传递的动力学方程进行了数值求解.结果表明电场脉冲可以在胶原蛋白分子中激发起酰胺键(amide-Ⅰ)振子的孤波,且在孤子产生的同时伴随有声子发射.