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【目的】白垩病是困扰养蜂生产的顽疾。目前,尚无利用二代测序技术研究中华蜜蜂（Apis cerana cerana,简称中蜂）幼虫白垩病的报道。本研究利用RNA-seq技术对健康（Ac CK）及球囊菌（Ascosphaera apis）胁迫的中蜂4日龄幼虫肠道（Ac T）进行深度测序,在转录组水平研究中蜂幼虫在球囊菌胁迫早期的胁迫应答。【方法】通过Illumina Hi Seq 2500平台对Ac CK和Ac T进行双端（PE125）测序,首先对测序数据进行质控和评估,利用edge R软件进行差异表达基因（