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从5个种群的南方鲇线粒体DNA扩增出约500 bp的细胞色素b基因(Cyt b),经Clustal X同源排序后得400 bp序列。21尾个体间遗传距离变化范围为0~0.0024,遗传一致度的变化范围为1~0.9976。结果显示在长江的上游支流中,南方鲇不同种群间在该基因片段上基本不存在变异。长江中游的洞庭湖种群与长江上游支流的各种群间在该基因片段上差异较大。比较分析了5个种群的南方鲇Cyt b基因并构建了遗传关系聚类图,雅砻江、岷江、宜宾、乌江4个种群聚为一支,洞庭湖种群聚为另一支。