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应用型本科教育是培养应用性、多能力和高素质人才。微生物学是生物工程专业的一门核心基础课,具有涉及面广、应用性强等特点。根据应用型本科教育的特点,结合笔者所在院校生物工程专业的培养目标和专业特色,从课程内容、教学方法和考核方式三个方面,探索和实践了应用型本科院校中微生物学理论教学的措施,为微生物学课程的教学质量提高和教学改革提供参考。