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为设计稻曲病菌(Ustilaginoidea virens)专化性PCR引物，测定了1991-2001年采集的多个水稻品种、不同水稻产区的菌株的ITS和5．8S rDNA区序列。U.virens的ITS1、ITS2和5．8S rDNA区域的长度为624-625bp，序列高度保守。在与麦角菌科其它种比较的基础上，设计了U.virens专化性嵌合引物。采用PCR方法可以灵敏地检测目标真菌，并且与传统的组织观察结果很好地吻合。这一结果为深入研究稻曲病的侵染规律和建立田间早期诊断技术提供了可能。