对2例脊髓性肌萎缩症(SMA)患者及其核心家系进行运动神经元存活基因1(SMN1)的点突变分析,评估2种SMN1点突变对全长SMN1基因(SMN1-fl)转录水平的影响,结合患者表型初步预测点突变对SMN蛋白及功能的影响。
方法采用多重连接依赖性探针扩增技术、RT-PCR、克隆测序结合基因组序列分析进行SMN1基因拷贝数和点突变分析,利用患者父母的基因分析明确突变的传递关系。通过实时定量PCR技术分析患者体内SMN1-fl的转录水平。以50名无神经肌肉萎缩病史的个体作为健康对照组,健康个体为含2个SMN1基因拷贝的个体,而健康携带者为纯合缺失患儿的父母(含1个SMN1基因拷贝)。
结果2例SMA患者的表型为Ⅱ型和Ⅲ型,SMN1基因分别存在p.Val19GlyfsX21和p.Ala2Gly突变,突变均来自患者父亲。健康个体、健康携带者、携带p.Val19Glyfs X21突变的患者和携带p.Ala2Gly突变的患者,其SMN1-fl mRNA表达量分别为23.5±4.9、14.1±4.5、4.9±2.4和13.9±3.6。t检验结果表明,携带上述突变的2例患者,其SMN1-fl mRNA表达量均明显低于健康个体(t=3.322,P=0.011;t=6.964,P=0.000),而与健康携带者相比,p.Ala2Gly突变的患者SMN1-fl mRNA表达量差异无统计学意义(t=0.058,P=0.955),携带p.Val19Glyfs X21突变的患者其SMN1-fl mRNA表达量显著下降,差异有统计学意义(t=3.725,P=0.004)。
结论共发现2种SMN1基因突变,p.Val19GlyfsX21为国际尚未见报道的新突变,p.Ala2Gly突变首次在中国患者中发现。前者可能通过无义突变介导的mRNA降解途径使SMN1-fl mRNA转录水平显著下降,而后者则并不影响SMN1-fl mRNA转录水平,对SMN蛋白功能的影响尚待研究。