结球白菜结球前期基因表达序列标签（EST）分析

来源 :农业生物技术学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：fsswczc

【摘要】

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以结球白菜(Brassica rapa L.ssp．pekinensis)结球前期心叶为材料，构建了结球前期球叶cDNA文库，随机挑选克隆单向单次测序后，共得到1162条峰图良好和插入片段长度大于150bp的可用

【作者】

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高瑞娟戴大鹏马荣才曹鸣庆晏月明王亚东任世军郭新

【机构】

：

北京农业生物技术研究中心,首都师范大学生物系,哈尔滨工业大学计算机科学学院,北京农业信息技术研究中心

【出处】

：

农业生物技术学报

【发表日期】

：

2004年1期

【关键词】

：

表达序列标签结球叶结球白菜同源性 expressed sequence tags(EST) heading leaf Chinese cabbage (B

【基金项目】

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国家高技术研究发展(863)计划课题(No.2001AA23108)

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以结球白菜(Brassica rapa L.ssp．pekinensis)结球前期心叶为材料，构建了结球前期球叶cDNA文库，随机挑选克隆单向单次测序后，共得到1162条峰图良好和插入片段长度大于150bp的可用序列。BLASTX及BLASTN序列比对分析表明，94．8％(1102／1162)的表达序列标签(EST)可在蛋白质或核苷酸水平上找到同源类似物。同源性最大的蛋白质按物种来源分析后发现，大约77％的功能已知蛋白质来自拟南芥(Arabidopsis thaliana)，另外还有60个EST与已发表的

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