产琥珀酸丝状杆菌内切葡聚糖酶end-1基因密码子偏好性分析

来源 :畜牧与饲料科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:vsbutcher00
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产琥珀酸丝状杆菌(Fibrobacter succinogenes)end-1基因表达的内切葡聚糖酶是能够降解纤维素的纤维素复合酶中的一种。利用Codon W、CUSP和CHIPS等相关软件分析产琥珀酸丝状杆菌内切葡聚糖酶end-1基因的密码子使用情况,比较end-1基因与大肠杆菌、酿酒酵母菌、枯草芽胞杆菌以及乳酸乳球菌的密码子偏好性。结果表明,内切葡聚糖酶end-1基因偏好使用G/C结尾的密码子,其中有25种偏好密码子(RSCU值大于1),偏好性较强的有GCT、TGC、GAA、GGT、CAC、ATC、C
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