基于肠道病毒A71型基因组研究其毒力相关位点

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目的

基于肠道病毒A71型(EV-A71)基因组探索研究其毒力相关位点。

方法

计算来源于轻症、死亡病例的EV-A71各段基因的遗传距离,分析基因同源性;对轻症、死亡病例来源的EV-A71的5′UTR区核苷酸、结构蛋白编码区和非结构蛋白编码区氨基酸进行比对,分析与EV-A71毒力相关的位点。

结果

来源于轻症和死亡病例的2株EV-A71均属C4a基因型,基因组同源性为96.2%~97.5%、5′UTR的第ⅴ结构域核苷酸相同,结构一致;结合从GenBank上下载的C4a型EV-A71的全基因组序列开展分析,结果显示在EV-A71蛋白编码区共发现4个氨基酸位点与病毒毒力相关,是潜在毒力位点,分别为非结构蛋白编码区的2 A区R68M、2C区K41R、3 A区T/V47A及3C区I158V。

结论

死亡病例和轻症病例来源的EV-A71非结构蛋白编码区部分氨基酸位点的变异可能与病毒毒力相关。

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