据笔者所知，很多科研人员往往希望做应用研究，认为应用研究更具经济效益，获取成果的周期短，而基础研究则相对周期长，经济效益也不明显。
　　的确，基础研究是为了认识现象，获取关于现象和事实的基本原理的知识而进行的实验性和理论性工作，而不考虑其直接的应用。在进行研究时对其成果的实际应用前景并不清楚。而应用研究的目的不外乎两类：一类是发展基础研究成果确定其可能用途，二类是为达到具体的预定的目标确定应采取的新方法和途径。应用研究虽然也是为了获得科学技术知识，但是，这种新知识是在开辟新的应用途径的基础上获得的，是对现有知识的扩展，为解决实际问题提供科学依据，对应用具有直接影响。基础研究获取的知识必须经过应用研究才能发展为实际运用的形式。
　　到底是做基础研究还是应用研究，究竟哪个更重要？估计大部分开始从事科研的工作者都会有这个疑问。倾向于基础研究的人常常会认为基础研究需要较高的理论水平，而且能发表有影响力的论文；而倾向于应用研究的人则认为，论文没多大用途，解决不了太多实际问题；而且有些基础研究的结论，与实际相反，比如，添加剂在传统营养研究中没有作用，而分子营养则可能有。
　　笔者认为，基础研究与应用研究是相辅相成的。没有基础研究的突破，应用研究很难得到长足的进展，但是没有应用研究的需求，基础研究的方向也难以把握。基础研究和应用研究的关系，就像根叶和果实的关系。根叶茂盛而不开花结果的树只有观赏价值而没有食用价值，但是果实的养分归根结底来自于根吸收的水分和养料，以及树叶光合而成的有机物。道理非常浅显，农民不会因为根叶没有食用价值而一味地求取果实。正如巴西圣保罗大学数理科学教授所说：“科学研究的动力不仅来自对于科学的好奇和热爱，更来自于一个研究领域比别的研究领域更受重视和高回报的观念的驱动。”可以说，没有基础理论的突破，就没有我们现在的工业化、现代化、信息化。
　　事实上，基础研究与应用目标在本质上是兼容的。如热力学这门学科起源于企图从数学上判定蒸汽机能做出多大的功这样一个有强烈应用色彩的研究目标。再如，法国科学家巴斯德关于甜菜汁酿酒问题的研究，就其有明确的应用目的而言，是典型的应用研究，它成功地促进了发酵技术，但同时这一研究也是杰出的基础研究，它大大地拓展了人们对生物世界的理解，使巴斯德不仅成为微生物学的奠基者，而且在细菌致病学说和免疫学方面做出了开创性的贡献。同时，随着高新技术的迅速发展，越来越多的学者与科学家认为，科学研究的目的就是为了造福人类，基础研究应该尽快向应用研究渗透。