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地质地球化学对比研究表明，玉龙含矿与非含矿斑岩是由岩石圈地幔中交代成因的金云母-石榴石单斜辉石岩脉发生不同程度部分熔融而形成的。含矿斑岩是最早阶段熔融体，主要是由交代成因脉中副矿物（如磷灰石和碳酸盐矿物等）和含水矿物金云母发生部分熔融而形成的，因而富含F、Cl和水等挥发份，加上该阶段岩浆具有高氧化性特征，从而富含Cu等成矿元素；非含矿斑岩是交代成因脉相对较高熔融程度的产物，单斜辉石和石榴石介入了熔融作用，岩浆熔体相对贫乏F、Cl和水等挥发份，加上该阶段岩浆具有较低的fo2，从而不利于成矿。斑岩体全岩的F和