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为建立一种简单、快捷的方法以鉴定梨种质资源，对CTAB法、SDS法和高盐法3种DNA提取方法进行了比较．结果表明，改良的CTAB法较为适合梨基因组DNA的提取．通过对TaqE，Mg^＋，dNTP“模板DNA”和primer不同浓度的优化实验以及对PCR反应程序的优化筛选，建立了适合梨基因组ISSR分析的技术体系．运用该体系对梨品种进行ISSR分析，结果表明，从100对引物中筛选出的10对引物能扩增清晰带且多态性好，从而达到鉴定梨种质资源的目的，并且应用该体系构建了新疆主要梨的遗传图谱和数字指纹图谱．