原发性大隐静脉曲张中lncRNAs的差异表达

来源 :同济大学学报(医学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:lixuhai88888
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目的比较大隐静脉(great saphenous vein,GSV)曲张血管与正常血管差异表达的lncRNA对大隐静脉曲张的影响,并预测其可能潜在的功能。方法应用表达谱芯片检测6对配对的曲张静脉(varicose vein,VV)和相邻正常节段大隐静脉(normal vein,NV)组织lncRNA表达差异,以qRT-PCR对32例患者样本进行验证;同时以基因芯片lncRNAs和mRNA差异的分层聚类分析、基因本体及通路分析注释差异表达的mRNA通路。结果在6对VV和NV中,存在557个lncRNAs和980个mRNA表达差异;其中6个通路与代谢相关,均得到了qRT-PCR验证。编码-非编码基因共表达网络提示,这6个lncRNA中有4个可能与11个mRNAs相关,且可能与8个代谢通路有关。结论曲张大隐静脉中存在lncRNA异常表达,为lncRNAs生理功能和静脉曲张病理发生提供了新视角。
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