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高新技术企业集聚有利于优化城市要素资源配置、提升城市竞争力。基于集聚经济理论,构建高新技术企业选址理论分析框架,利用2003～2013年的城市统计年鉴和中国工业企业数据,实证我国高新技术企业选址的影响因素并进行异质性分析。结果表明,从总体看,城市外商直接投资、货运总量、知识溢出等对高新技术企业选址存在显著影响,但交通基础设施、行政审批等因素不显著;从分样本看,对于不同所有制企业和不同经济发展阶段、不同区域属性的城市,高新技术企业选址偏好具有较大的差异。基于此,从完善城市基础设施建设、积极引进优质创新